上海瑞金醫(yī)院建于1907年，原名廣慈醫(yī)院，是一所三級甲等大型綜合性教學醫(yī)院。醫(yī)院占地面積12萬平方米，建筑面積24.5萬平方米，綠化面積4萬平方米，核定床位1600張，全院職工3445人，其中醫(yī)師1010余人（其中正副教授及各類高級科技人員593人）。擁有中國科學院院士陳竺、中國工程院院士王振義、陳賽娟等一大批在國內(nèi)外享有較高知名度的醫(yī)學專家。醫(yī)院設有34個臨床科室、9個醫(yī)技科室；現(xiàn)有國家教育部重點學科3個（內(nèi)分泌、血液、消化），上海市重中之重學科1個（血液），上海市重點學科1個（內(nèi)分泌），上海市優(yōu)勢學科一個（腎臟），上海市教委重點學科6個（消化外科、血液科、內(nèi)分泌科、骨科、燒傷科、心臟內(nèi)科），上海市衛(wèi)生局醫(yī)學領先專業(yè)重點學科3個（消化外科、血液科、腎臟內(nèi)科）。醫(yī)院還有6個市級研究所（上海市傷骨科研究所、上海市高血壓研究所、上海市內(nèi)分泌研究所、上海燒傷研究所、上海血液學研究所、上海消化外科研究所），2個校級研究所（上海交通大學醫(yī)學院神經(jīng)病學研究所、上海交通大學心血管病研究所），1個院級研究所（感染病與呼吸病研究所），8個校級研究室，3個院級實驗室。此外，還建立了國家重點實驗室和教育部重點實驗室各1個（醫(yī)學基因組學重點實驗室），2個衛(wèi)生部重點實驗室（人類基因組重點實驗室、內(nèi)分泌代謝重點實驗室），4個上海市重點實驗室（人類基因組研究重點實驗室、血管生物學重點實驗室、中西醫(yī)防治骨關節(jié)病損重點實驗室、內(nèi)分泌腫瘤重點實驗室）。并通過整合上述科研力量，建立了附屬瑞金醫(yī)院生物醫(yī)學研究院。同時，還建有與臨床診療密切結(jié)合的一些中心，包括分子醫(yī)學中心、糖尿病研究中心、血栓與止血研究中心、血液病診治中心、基因診斷中心、眼科中心、青少年生長發(fā)育中心、介入治療中心、生殖醫(yī)學中心等。另外上海市衛(wèi)生局有4個質(zhì)量控制中心（康復、骨科、心臟介入、血液）掛靠在瑞金醫(yī)院。

    瑞金醫(yī)院于20世紀50年代成功搶救邱財康后，大面積燒傷治療始終處于世界先進水平；70年代在國內(nèi)率先開展了心臟和肝臟的移植手術；90年代在白血病分子生物學研究和臨床醫(yī)療領域取得了重大進展；21世紀日臻完善的器官移植，使得許多病人將這里視為生命的綠洲。為此，醫(yī)院獲得了全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體（6次）、全國百佳醫(yī)院；全國創(chuàng)建文明行業(yè)先進集體、全國衛(wèi)生系統(tǒng)先進思想政治工作研究會；上海市文明單位（9次）；全國模范職工之家；全國青年文明號、全國“五四”紅旗團組織創(chuàng)建單位等。

    瑞金醫(yī)院以所取得的成就和榮譽為動力，為了進一步適應市場需求，醫(yī)院積極開展高精尖診療技術，如微創(chuàng)傷手術、關節(jié)鏡手術、心血管介入治療、眼科準分子激光術等，并充分利用醫(yī)院綜合醫(yī)療優(yōu)勢，實行多學科或跨學科聯(lián)合會診制，使醫(yī)療診治水平日益提高。同時醫(yī)院還將發(fā)展目標定位在研究型醫(yī)院上，借助醫(yī)院9個市級研究所，醫(yī)院在腎臟內(nèi)科、消化內(nèi)科、內(nèi)分泌、高血壓、中醫(yī)傷科、急性壞死性胰腺炎、生殖醫(yī)學等學科中頗具特色，特別是國家重點研究所的科研優(yōu)勢，立足臨床加大科研力度，為人民健康創(chuàng)造出了許多臨床新成果。醫(yī)院還不斷深化人性化服務，推出了“以優(yōu)質(zhì)的醫(yī)療使病人放心、以一流的服務使病人稱心、以優(yōu)美的環(huán)境使病人舒心”的“三心工程”，以溫馨、便捷、優(yōu)質(zhì)、高效的服務贏得了社會和病家的信任，促進了醫(yī)院兩個文明建設的發(fā)展。

    瑞金醫(yī)院是上海交通大學醫(yī)學院最大的臨床教學基地，“瑞金臨床醫(yī)學院”也設在醫(yī)院中，承擔醫(yī)學系、檢驗系、高級護理系的臨床教學任務，并接受上海交通大學醫(yī)學院夜大學、高級醫(yī)師進修班及來自全國各地醫(yī)院的進修學員的臨床教學任務。

    近年來，瑞金醫(yī)院獲得各類科研項目300余項，包括國家自然科學基金重大項目、重點項目、面上項目、國家科委863項目、S863項目、973項目、攀登計劃、國家八五攻關項目、九五攻關項目、衛(wèi)生部科研項目、國家教委留學生基金項目、上海市級科研項目等重大項目。醫(yī)院現(xiàn)有碩士生點29個、博士生點22個，具有招生資格的博士生導師66名、具有招生資格的碩士生導師84名，內(nèi)、外科均為博士后流動站。醫(yī)院的科研技術人才在國家杰出人才基金、國家教委跨世紀人才培養(yǎng)基金、上海市啟明星計劃、啟明星后計劃、上海市曙光計劃、上海市衛(wèi)生系統(tǒng)百名跨世紀優(yōu)秀學科帶頭人計劃中占有較重比例。還獲得一系列有很高含金量的國際獎項，如：美國灼傷協(xié)會伊文思獎，意大利惠特克國際燒傷獎，美國凱特林癌癥獎，瑞士布魯巴赫癌癥研究獎，法國盧瓦茨獎和祺諾臺杜加獎，以及香港何梁何利基金技術獎等。為了引進先進的技術和設備，瑞金醫(yī)院還積極開展對外交流與協(xié)作，與法國、美國、英國、加拿大、比利時、日本、澳大利亞等國家和香港、臺灣、世界衛(wèi)生組織等地區(qū)和組織有著廣泛的聯(lián)系，并建立了多項科研合作。。。

    1999年8月4日，為了貫徹落實國家衛(wèi)生改革工作的精神，探索市場經(jīng)濟條件下醫(yī)院發(fā)展的新模式，實現(xiàn)“以比較低廉的價格提供比較優(yōu)質(zhì)服務”的宗旨，瑞金醫(yī)院率先與部分醫(yī)療機構(gòu)實行資產(chǎn)重組，建立了上海瑞金醫(yī)院集團，初步實現(xiàn)了跨地區(qū)、跨行業(yè)、跨級別、跨部門醫(yī)療資源的重組，使以瑞金醫(yī)院為核心的區(qū)域醫(yī)療衛(wèi)生中心逐步形成。多年來，瑞金醫(yī)院與集團下屬的醫(yī)院分部、盧灣分院、閔行醫(yī)院和臺州中心醫(yī)院都取得了明顯的經(jīng)濟效益和社會效益。

    2002年10月25日，瑞金醫(yī)院在科研工作模式的探索上又邁出了堅實的一步，在國內(nèi)開創(chuàng)性的成立了“生物醫(yī)學研究院”。從而形成了“大科研”的新格局，實現(xiàn)科研體制、用人機制和科學研究等的全面創(chuàng)新。該研究院以瑞金醫(yī)院的研究力量為主，聯(lián)合中國科學院上海生命科學研究院、原上海第二醫(yī)科大學健康科學中心、國家人類基因組南方中心等科研單位，是我國第一個以醫(yī)院為主體的、將生命科學與臨床醫(yī)學緊密結(jié)合的研究與開發(fā)機構(gòu)。研究院所奉行的“但求所用，不求所有”的用人原則，真正實現(xiàn)了人才的“柔性流動”，使更多科研人員有了施展才華的舞臺和空間。

    2009年瑞金醫(yī)院門急診人次達251.4萬，手術例數(shù)達3.94萬次，出院病人7.18萬人次，平均住院天數(shù)為8.73天。